예장 고신과 고려는 신사참배와 공산주의에 맞선 순교신앙을 한 뿌리로 가지고 있으나 지난 1976년 제26회 총회 시 ‘신자 간의 사회법정 소송에 대한 이견’으로 분열됐다. 그러나 분열의 원인이 된 사회법정 소송 문제는 “고린도전서 6장 1-10절의 말씀에 의지하여 ‘성도 간의 사회법정 소송은 원칙적으로 불가하다’라는 원리가 옳은 줄로 믿는다”는 데 의견 일치를 이뤄 최근 통합 합의가 이뤄졌다.

 양측은 합의문에서 ▲통합 시 양 총회의 모든 역사(총회 회기, 교회 역사, 신학교 졸업 기수 등)는 병합되며, 고려총회의 노회는 그대로 유지하고 통합 총회의 행정 개편과 함께 지역노회로 편성한다. ▲양 총회 소속의 목사·선교사·교역자의 신분은 헌법대로 보장하며, 항존직을 비롯한 교회의 직분은 그대로 유지된다. 교회(당)는 가급적 유지재단 가입을 권장하고, 목회자에게 은급(연금)제도 혜택 및 계속 수학의 기회 등은 양 총회 공히 동등하게 제공한다. ▲고려신학교 신학원(M.Div 과정)은 고려신학대학원의 역사와 병합하며, 졸업자의 학적은 고려신학대학원에서 관리하고, 재학생은 신입생으로 입학(특례)하게 한다. 고려신학교 여자신학원은 해 노회에서 운영한다. 통합에 따른 경과조치와 추후 필요한 사항은 양 총회 통합위원회가 합의해서 처리한다 등의 내용을 담고 있다.

한편 이번 통합으로 고신총회는 2113개 교회, 55만 성도 규모의 중대형 교단으로 발돋움하게 된다.